树根部分即理学（metaphysics），涉及哲学、方法论等领域，包括阴阳学、老庄哲学、朱熹理学、王阳明心法等。
这些内容由最核心的人员，如笛卡尔等，进行研究和转化。
树干部分则称为物学（physics），涵盖中华典籍中的数学、天文、地理、历法等基础研究。
由于内容复杂，由核心人员主导，同时普通人员如费马、艾基纳·帕斯卡等也共同参与。
树枝部分简化为医学、机械学和社会道德三大分科，涵盖医术、航海、工艺、农艺、戏剧等领域。
由于内容庞杂且晦涩难懂，梅森会允许外围学者如伽利略和海尔蒙特等共同参与研究。‘
他们虽未加入梅森会，但对新奇的学术知识充满兴趣，与梅森会往来密切。
梅森带领六十多名梅森会成员参加赴美洲观察团的原因主要有几个：
其一，黎塞留要求梅森会尽快获取麻醉剂、消毒剂、石油提炼等技术，以提升法兰西综合实力，并避免对美洲产生依赖。
其二，梅森会学者在研究中华典籍时遇到许多难以理解的内容，希望到美洲寻找答案，如算盘的作用、天球坐标系中的阴阳概念等。
其三，海尔蒙特在研究火药时，意外发现硝酸、硫酸与棉花混合能生成一种不稳定的爆炸物质。
作为梅森会的外围成员，他将这一发现寄给了梅森，期盼梅森能召集更多炼金师共同研究。
起初，梅森对炼金术并不热衷。然而，欧洲刺客兄弟会的多次成功刺杀让教皇心生忧虑。教皇责令梅森迅速查明步枪和子弹的制造方法，并探寻防御之道。
随后，梅森得知罗科塔岛已被远征军团占领，但岛上仍有部分东方典籍未能及时运回欧洲。
此次前来，他也想趁机获取这些典籍，并将它们带回欧洲。
听完梅森的交代，冷秉眼神微凝，沉声发问：
“我有两个疑问：
其一，黎塞留对我远征军团持何态度？
其二，今年以来，里奥斯与你联络过几次，具体时间为何？”
梅森看了冷秉一眼，随即目光投向了哈维，带着询问之意。
“这次审讯，是王子阁下的意思。我代表美洲的方济各会，也代表如今的‘先知天主教’。
而这位是冷秉将军，他是王子阁下的亲信，还请有问必答。”哈维抬了抬手，缓缓介绍道。
听到介绍，梅森的态度立刻变得恭敬，他正色解释道：
“对黎塞留大主教来说，无论是权利、财富还是信仰都没有法兰西王国的未来重要。
远征军团削弱了西班牙在美洲殖民地的势力，使得大量的金银无法运回塞维利亚，这一举措极大削弱了哈布斯堡联盟的力量，尤其使得天主教盟军的军费和物资供应困难。
因此，黎塞留大人对远征军团持欣赏和支持态度。
至于里奥斯，今年就给我捎过一次信笺，信笺是二月份从新阿姆斯特丹发出的，自那以后，就没有再联络过。”
听到这话，冷秉微微颔首，看来这个梅森并未撒谎。
首先，朱雀军突击大队攻下新法兰西的魁北克省是在今年五月份，消息要传到法国，至少是七八月份的事情。
其次，里奥斯三月底离开新阿姆斯特丹，到达欧洲怎么也要六七月份，而梅森等人五月份就从法兰西出发，所以他们并未会面也在情理之中。
见两位审讯官不再发问，梅森鼓起勇气询问道：
“不知我犯下的罪行会受到何种审判？”
“怎么，你怕了？”冷秉瞥了他一眼，目光中带着鄙夷。
梅森面容沮丧地瘫坐在地上，沉默了很久才缓缓开口：
“我的确很害怕，但可怕的并非死亡本身，而是失去继续探寻真知的机会。
在来美洲之前，那些从东方寄来的文献已让我沉醉其中。然而，我耗尽半身心血，也只探得一些皮毛，这让我痛苦不已。
来到美洲后，这里的所见所闻更让我仿佛踏入了一个全新的世界。
毁天灭地的火器、夜间亮如白昼的汽灯、储存数年不腐的罐头、冒着黑烟却能逆风疾驰的帆船，还有墨西哥城那些可以载人的飞行器，这些无一不吸引着我。”
说到此处，梅森突然激动起来，他趴伏在地，高声祈求：
“请不要绞死我，我愿意加入先知天主教，为王子阁下效力，为曾经犯下的过错赎罪！”
哈维叹了口气，满是皱纹的脸上露出悲悯之色，他望向冷秉，协商道：
“梅森虽然有错，可身为索邦神学院的神甫，不得不遵循教皇的谕旨，也不能不听黎塞留的命令。
如今他已幡然醒悟有了悔改之意，对他的判罚，是否可以从轻发落？”
沉吟片刻，冷秉皱了皱眉，摇头说道：
“是否从轻惩处，你我皆无决定权，此事须由军团长定夺。
依我之见，怕是希望渺茫。
其一，梅森乃主犯，其不仅有抄袭之实，更召集众人剽窃，罪责深重，不可饶恕。
其二，他剽窃的是《律吕精义》，此书乃大明郑王世子朱载堉所着，而朱载堉是军团长的远方叔伯，这侵犯了皇家威严。
其三，参谋长对他的学术能力评价为乙中，所以就算他想赎罪，军团长也未必会看重。
最后，如今新法兰西已被攻克，魁北克等领地也纳入我军团的版图，黎塞留恐怕已视我等为死敌。
在这种情况下，我不相信梅森还有能力从欧洲吸引更多学者前来。”
闻言，梅森如遭雷击，宛若石雕僵在原地。
他怎么也没想到新法兰西已经被攻克，更没想到那么多书不挑，却挑了一本是王子阁下叔伯所着的作品抄袭。
最令他绝望的是，自己的能力对方看不上，连投靠的资格都没有，这无异于被判了死刑。
“不……不是的，我有价值，很有价值。”梅森如溺水之人，拼命挣扎，想要自救。