鬼门十三针是由《鬼门十三针·针刺篇》中的鬼封、鬼宫、鬼窟、鬼垒、鬼路、鬼市、鬼堂、鬼枕、鬼心、鬼腿、鬼信、鬼营、鬼藏、鬼臣等。十三鬼穴中选其对癫、狂、痫有奇特治疗作用的腧穴，经过十余代人的经验总结，并增补数穴而成，沿用至今。
孙真人针十三鬼穴歌
百邪颠狂所为病，针有十三穴须认，凡针之体先鬼宫，次针鬼信无不应。
一一从头逐一求，男从左起女从右，一针人中鬼宫停，左边下针右出针，
第二手大指甲下，名鬼信刺三分深，三针足大指甲下，名曰鬼垒入二分，
四针掌后大陵穴，入针五分为鬼心，五针申脉为鬼路，火针三下七锃锃，
第六却寻大椎上，入发一寸名鬼枕，七刺耳垂下五分，名曰鬼牀针要温，
八针承浆名鬼市，从左出右君须记，九针劳宫为鬼窟，十针上星名鬼堂，
十一阴下缝三壮，女玉门头为鬼藏，十二曲池名鬼臣，火针仍要七锃锃，
十三舌头当舌中，此穴须名是鬼封，手足两边相对刺，若逢狐穴只单通，
此是先师真妙诀，狂猖恶鬼走无踪。
一针鬼宫，即人中，入三分。
二针鬼信，即少商，入三分。
三针鬼垒，即隐白，入二分。
四针鬼心，即大陵，入五分。
五针鬼路，即申脉（火针），三下。
六针鬼枕，即风府，入二分。
七针鬼牀，即颊车，入五分。
八针鬼市，即承浆，入三分。
九针鬼窟，即劳宫，入二分。
十针鬼堂，即上星，入二分。
十一针鬼藏，男即会阴，女即玉门头，入三分。
十二针鬼臣，即曲池（火针），入五分。
十三针鬼封，在舌下中缝，刺出血，仍横安针一枚，就两口吻，令舌不动，此法甚效。
更加间使、后溪二穴尤妙。男子先针左起，女子先针右起。
单日为阳，双日为阴。阳日、阳时针右转，阴日、阴时针左转。
刺入十三穴尽之时，医师即当口问病人；何妖何鬼为祸，病人自说来由，用笔一一记录，言尽狂，方宜退针。
针邪密要
凡男妇或歌或笑，或哭或吟，或多言，或久默，或朝夕嗔胀，或昼夜妄行，或口眼俱斜，或披头跣足，或裸形露体，或桑见神鬼，如此之类，乃飞虫精灵，妖孽狂鬼，百邪侵害也。欲治之时，先要愉悦：谓病家敬信医人，医人诚心疗治。两相喜悦，邪鬼方除。若主恶砭石,不可以言治，医贪货财，不足以言德。
书符：先用朱砂书太乙灵符一道，一道烧灰酒调，病人服，一道贴于病人房内。书符时，念小天罡咒。
念咒：先取气一口，次念天罡大神，日月常轮，上朝金阙，下覆昆仑，贪狼巨门，禄存文曲，廉真武曲，破军辅弼，大周天界，细入微尘，玄黄正气，速赴我身，所有凶神恶煞，速赴我魁之下，母动母作，急急如律令。
定神：谓医与病人，各正自已之神。神不定勿刺，神已定可施。
正色：谓持针之际，目无邪视，心无外想，手如握虎，势若擒龙。祷神：谓临针之时，闭目存想一会针法，心思神农黄帝，孙韦真人，俨然在前，密言从吾针后，病不许复。乃掐穴咒曰：大哉乾元，威统神天，金针到处，万病如拈，吾奉太上老君，急急如律令。
咒针：谓下手入针时，呵气一口于穴上，默存心火烧过，用力徐徐插入，乃咒曰：布气玄真，万病不侵，经络接积，龙降虎升，阴阳妙道，插入神针，针天须要开，针地定教裂，针山须使崩，针海还应竭，针人疾即安，针鬼悉馘灭。吾奉太上老君，急急如律令摄。
又咒曰：手提金鞭倒骑牛，唱得黄河水倒流，一口吸尽川江水，运动人身血脉流，南斗六星，北斗七星。太上老君，急急如律令。